Die Teilprojekte innerhalb des TrendDNA Konsortiums
Mit den eingelagerten und konservierten Proben der Umweltprobenbank soll die Veränderung der Biodiversität in den Letzten Jahrzenten in Deutschland rekronstuiert werden. Hierzu werden terrestrische, limnische und marine Probentypen
der Umweltprobenbank genetisch analysiert und so Trends entschlüsselt.
Terrestrische Habitate
Probenarten:
- Blathomogenate (Buche, Fichte, Kiefer,Pappel)
- Regenwürmer und Regenwurmkot
- Bodenproben
Analysen:
- Untersuchung der mit Blättern assoziierten Arthropodengemeinschaften
- Untersuchung des Mikrobioms von Regenwürmern sowie Genomanalysen der Regenwürmer
- Untersuchung der Makroorganismen sowie Mikroorganismen in Bodenenproben
Methoden:
- DNA-Metabarcoding
- Shotgun Sequenzierung
Bearbeiter*innen:
- Universität Trier
- Senckenberg Gesellschaft
Limnische Habitate
Probenarten:
- Schwebstoffproben der Flüsse Rhein, Elbe und Donau
- Dreikantmuscheln
Analysen:
- Untersuchung der Umwelt-DNA von Wirbeltieren und Wirbellosen in den Schwebstoffproben
- Untersuchung der Kommensalen und Parasiten der Dreikantmuscheln sowie der aufgenommenen planktonischen Nahrungspartikel
Methoden:
- DNA-Metabarcoding
Bearbeiter*innen:
- Universität Duisburg-Essen
- Universität Trier
- Fraunhofer Institut
Marine Habitate
Probenarten:
- Miesmuscheln
- Blasentang
Analysen:
- Untersuchung der Kommensalen und Parasiten der Miesmuscheln sowie der aufgenommenen planktonischen Nahrungspartikel
- Untersuchung der bakteriellen Gemeinschaften des Blasentangs im Anschluss an die Untersuchung der Metazoen-Gemeinschaft
Methoden:
- DNA-Metabarcoding
Bearbeiter*innen:
- Universität Trier
