Das Projekt TrendDNA wird für das Umweltbundesamt von der Universität Duisburg-Essen und der Universität Trier, sowie von der Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung und dem Fraunhofer Institut für Molekularbiologie und Oekologie IME umgesetzt. In enger zusammenarbeit werden die verschiedenen Proben von den jeweiligen Experten bearbeitet und wissenschaftliche Fragestellungen beantwortet.